Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Akip1Q9JJR5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akip1Q9JJR5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms