Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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