Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riox1Q9JJF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms