Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1Q9JIT0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms