Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prmt1Q9JIF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prmt1Q9JIF0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms