Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LratQ9JI60 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms