Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtaQ9JHK4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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