Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Exosc9Q9JHI7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms