Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tm9sf3Q9ET30 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms