Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rb1cc1Q9ESK9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms