Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp29Q9ES63 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms