Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms