Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb3Q9ERD7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb3Q9ERD7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms