Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms