Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef4Q9EQZ6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef4Q9EQZ6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef4Q9EQZ6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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