Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf21Q9EPU5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms