Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlr1Q9EPQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlr1Q9EPQ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlr1Q9EPQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlr1Q9EPQ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlr1Q9EPQ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tlr1Q9EPQ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr1Q9EPQ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms