Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hmg20aQ9DC33 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hmg20aQ9DC33 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hmg20aQ9DC33 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hmg20aQ9DC33 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hmg20aQ9DC33 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmg20aQ9DC33 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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