Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf6Q9DBU5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf6Q9DBU5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms