Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm2aQ9DAR1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2aQ9DAR1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms