Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb1Q9DAK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb1Q9DAK3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb1Q9DAK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb1Q9DAK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhobtb1Q9DAK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms