Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift43Q9DA69 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift43Q9DA69 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms