Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actrt1Q9D9J3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms