Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg7Q9D906 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.5 ms