Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fip1l1Q9D824 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fip1l1Q9D824 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms