Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slx4ipQ9D7Y9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms