Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rep15Q9D7T1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rep15Q9D7T1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rep15Q9D7T1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms