Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp4cQ9D7F7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms