Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb1Q9D5L7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb1Q9D5L7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms