Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Taf1dQ9D4V4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Taf1dQ9D4V4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf1dQ9D4V4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1dQ9D4V4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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