Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931428L18RikQ9D4S9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms