Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms