Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf6Q9D4J7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf6Q9D4J7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms