Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcc1Q9D4H2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms