Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4933428M09RikQ9D3X3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms