Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pus10Q9D3U0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus10Q9D3U0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms