Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx29Q9D3S3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx29Q9D3S3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx29Q9D3S3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms