Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rufy3Q9D394 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms