Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp5Q9D387 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms