Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700034E13RikQ9D2T6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms