Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc8bQ9D2D9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc8bQ9D2D9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms