Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6bQ9D289 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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