Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem53Q9D0Z3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms