Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nde1Q9CZA6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms