Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssu72Q9CY97 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms