Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CXL3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms