Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp23Q9CX11 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp23Q9CX11 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms