Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd12Q9CWU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd12Q9CWU0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms