Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ly6kQ9CWP4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ly6kQ9CWP4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms