Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn3Q9CVD2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms